基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013218 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:26138393-26139601 (-) |
| 描述 | Similar to At3g27150: F-box/kelch-repeat protein At3g27150 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013218 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g27150 |
F-盒/Kelch 重复蛋白 At3g27150。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g26930 |
F-box/kelch重复蛋白 At1g26930。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g02870 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g60570 |
F-box/kelch重复蛋白 At5g60570。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g74510 |
F-box/kelch 重复蛋白 At1g74510。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.527; 覆盖度=87.811; E 值=3.63e-67; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.911; 覆盖度=98.259; E 值=1.12e-142; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.554; 覆盖度=95.274; E 值=1.21e-68; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005777 | peroxisome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.554; 覆盖度=95.274; E 值=1.21e-68; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.911; 覆盖度=98.259; E 值=1.12e-142; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G26930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.554; 覆盖度=95.274; E 值=1.21e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G74510 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.819; 覆盖度=89.303; E 值=2.44e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.527; 覆盖度=87.811; E 值=3.63e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G27150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.911; 覆盖度=98.259; E 值=1.12e-142 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G60570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.825; 覆盖度=96.517; E 值=3.56e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |