基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013049 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:23115170-23118071 (-) |
| 描述 | Similar to ARF18: Auxin response factor 18 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_013049 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 19 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g28350 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g30080 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0685700 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os10g0479900 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0628600 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007389 | pattern specification process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009743 | response to carbohydrate | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010154 | fruit development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031540 | regulation of anthocyanin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048441 | petal development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048442 | sepal development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048589 | developmental growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048829 | root cap development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035198 | miRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28350 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.501; 覆盖度=101.42; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G30080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.046; 覆盖度=95.597; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0628600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.287; 覆盖度=99.148; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0685700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.611; 覆盖度=98.58; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0479900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.491; 覆盖度=98.295; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |