基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013048 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:23108415-23114249 (+) |
| 描述 | Similar to PPP6R3: Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 (Gallus gallus OX%3D9031) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013048 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009966 | regulation of signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.807; 覆盖度=72.015; E 值=1.66e-61; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.807; 覆盖度=72.015; E 值=1.66e-61; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0036464 | cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.511; 覆盖度=73.756; E 值=1.93e-60; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019888 | protein phosphatase regulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019903 | protein phosphatase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | gga:423116 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.093; 覆盖度=66.542; E 值=1.52e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:55291 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.598; 覆盖度=66.542; E 值=1.04e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:9701 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.167; 覆盖度=83.458; E 值=3.6e-59 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:52036 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.807; 覆盖度=72.015; E 值=1.66e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |