基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012837 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:19597827-19600151 (+) |
| 描述 | Similar to At3g10080: Germin-like protein subfamily 3 member 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012837 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g10080 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g02335 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g09560 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0532500 |
可能在植物防御中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010497 | plasmodesmata-mediated intercellular transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000280 | regulation of root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.444; 覆盖度=80.859; E 值=6.01e-48; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.444; 覆盖度=80.859; E 值=6.01e-48; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004784 | superoxide dismutase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.706; 覆盖度=82.422; E 值=3.86e-48; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030145 | manganese ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G02335 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.743; 覆盖度=85.156; E 值=3.73e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G09560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.444; 覆盖度=80.859; E 值=6.01e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G10080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.853; 覆盖度=76.953; E 值=4.19e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0532500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.741; 覆盖度=78.516; E 值=4.16e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |