基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012745 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:18090100-18092885 (-) |
| 描述 | Similar to THA1: Probable low-specificity L-threonine aldolase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012745 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g08630 |
苏氨酸醛缩酶参与苏氨酸降解为甘氨酸。 | |
At3g04520 |
苏氨酸醛缩酶参与苏氨酸降解为甘氨酸。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006545 | glycine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006567 | L-threonine catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.349; 覆盖度=87.755; E 值=4.4e-179; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004793 | threonine aldolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008732 | L-allo-threonine aldolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ag:BAA20404 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.81; 覆盖度=85.714; E 值=1.45e-100 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G08630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.751; 覆盖度=90.306; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G04520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.349; 覆盖度=87.755; E 值=4.4e-179 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cel:CELE_R102.4 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.828; 覆盖度=88.776; E 值=1.18e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ece:Z1104 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.073; 覆盖度=83.929; E 值=1.68e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ecs:ECs_0956 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.073; 覆盖度=83.929; E 值=1.68e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |