基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012560 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:14602694-14606914 (-) |
| 描述 | Similar to algC: Phosphomannomutase/phosphoglucomutase (Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / NCIMB 11950 / KT2440) OX%3D160488) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012560 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006006 | glucose metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.392; 覆盖度=78.14; E 值=9.98e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009298 | GDP-mannose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042121 | alginic acid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.392; 覆盖度=78.14; E 值=9.98e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000287 | magnesium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004614 | phosphoglucomutase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004615 | phosphomannomutase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | nma:NMA1001 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.557; 覆盖度=78.14; E 值=7.38e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nme:NMB0790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.378; 覆盖度=72.431; E 值=3.21e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ppu:PP_5288 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.514; 覆盖度=81.24; E 值=5.15e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pst:PSPTO_0083 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.357; 覆盖度=73.083; E 值=9.8e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |