基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012289 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:9804612-9808331 (-) |
| 描述 | Similar to UBA2B: UBP1-associated protein 2B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_012289 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g41060 |
异质核核糖核蛋白 (hnRNP) 样蛋白，作为调节细胞核中 mRNA 周转的复合物的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g56860 |
异质核核糖核蛋白 样蛋白，作为调节细胞核中 mRNA 周转的复合物的组成部分。 | |
At3g15010 |
异质核核糖核蛋白 (hnRNP) 样蛋白，作为调节细胞核中 mRNA 周转的复合物的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g22090 |
作为复合物的组分，调节细胞核中 mRNA 的周转。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0265800 |
RNA结合蛋白，结合位于小麦蛋白RNA 5'-CDS中的顺式定位元件或邮政编码。 |
Characterization of RNA binding protein RBP-P reveals a possible role in rice glutelin gene expression and RNA localization.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0191-z
|
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009693 | ethylene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.772; 覆盖度=57.123; E 值=6.69e-74; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010150 | leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012501 | programmed cell death | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048255 | mRNA stabilization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.772; 覆盖度=57.123; E 值=6.69e-74; UniProt GO evidence=NAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051028 | mRNA transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.479; 覆盖度=32.918; E 值=3.02e-70; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.991; 覆盖度=31.95; E 值=1.91e-50; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035925 | mRNA 3'-UTR AU-rich region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.772; 覆盖度=57.123; E 值=6.69e-74; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.226; 覆盖度=17.151; E 值=2.17e-35; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G22090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.226; 覆盖度=17.151; E 值=2.17e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G41060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.848; 覆盖度=63.9; E 值=4.01e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G15010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.991; 覆盖度=31.95; E 值=1.91e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.772; 覆盖度=57.123; E 值=6.69e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0265800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.479; 覆盖度=32.918; E 值=3.02e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |