基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_011629 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:168541416-168543552 (-) |
| 描述 | Similar to YAO: U3 snoRNP-associated protein-like YAO (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_011629 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g05410 |
核仁小核核糖核蛋白颗粒 (snoRNP) 的组成部分，据信参与前核糖体 RNA 的加工和修饰（通过相似性推测）。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g21130 |
核仁小核核糖核蛋白颗粒 (snoRNP) 的组成部分，据信参与前核糖体 RNA 的加工和修饰（通过相似性推测）。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0625900 |
核仁小核核糖核蛋白颗粒 (snoRNP) 的组成部分，据信参与前核糖体 RNA 的加工和修饰（通过相似性推测）。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009553 | embryo sac development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030490 | maturation of SSU-rRNA | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=2.6e-94; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042274 | ribosomal small subunit biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=1.44e-94; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0060321 | acceptance of pollen | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=2.6e-94; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031428 | box C/D methylation guide snoRNP complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=1.44e-94; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032040 | small-subunit processome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080008 | Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=2.6e-94; UniProt GO evidence=HDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030515 | snoRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034511 | U3 snoRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G05410 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.361; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G21130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.584; 覆盖度=94.737; E 值=3.63e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0625900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.478; 覆盖度=96.296; E 值=3.19e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:9136 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=2.6e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:27966 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.443; 覆盖度=84.016; E 值=1.44e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |