基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_010714 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:152014822-152016018 (-) |
| 描述 | Similar to At5g07610: F-box protein At5g07610 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010714 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g07610 |
F-box蛋白 At5g07610。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g17530 |
F-box/kelch 重复蛋白 At3g17530。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g12560 |
SCF(ASK- Cullin-F-box) E3泛素连接酶复合物的组分,可能介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解(通过相似性)。 | |
At4g04690 |
推定仅含 F-box 的蛋白 15。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g11620 |
假定 F-box/LRR 重复/kelch 重复蛋白 At1g11620。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.941; 覆盖度=60.05; E 值=6.53e-08; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009626 | plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031348 | negative regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042177 | negative regulation of protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.84; 覆盖度=106.533; E 值=3.03e-47; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G11620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.442; 覆盖度=52.261; E 值=1.28e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G17530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=23.529; 覆盖度=72.613; E 值=1.31e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G04690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.941; 覆盖度=60.05; E 值=6.53e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G12560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.639; 覆盖度=61.307; E 值=2.47e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G07610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.84; 覆盖度=106.533; E 值=3.03e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |