基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_010577 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:149298289-149303529 (-) |
| 描述 | Similar to Os07g0555200: Eukaryotic translation initiation factor 4G (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010577 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g60240 |
蛋白质复合物 eIF4F 的组成部分,参与 mRNA 帽的识别、5' 末端二级结构的 ATP 依赖性解旋以及 mRNA 向核糖体的募集。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0555200 |
蛋白质复合物 eIF4F 的组成部分,参与 mRNA 帽的识别、5' 末端二级结构的 ATP 依赖性解旋以及 mRNA 向核糖体的募集。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0611500 |
在病毒感染过程中在sobemovirus(RYMV)的积累中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006413 | translational initiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.556; 覆盖度=59.412; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006417 | regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.099; 覆盖度=63.529; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016281 | eukaryotic translation initiation factor 4F complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.099; 覆盖度=63.529; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.099; 覆盖度=63.529; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003743 | translation initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.099; 覆盖度=63.529; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | cmo:103496918 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.099; 覆盖度=63.529; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0555200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.556; 覆盖度=59.412; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |