基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_010070 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:139348676-139351521 (-) |
| 描述 | Similar to TOM1: Tobamovirus multiplication protein 1 (Nicotiana tabacum OX%3D4097) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010070 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g21790 |
烟草花叶病毒有效的细胞内增殖所必需的,可能是促进复制复合物形成的膜锚。 | |
At2g02180 |
有助于烟草花叶病毒的细胞内增殖,可能是促进复制复合物形成的膜锚。 | |
At1g14530 |
有助于烟草花叶病毒的细胞内增殖,可能是促进复制复合物形成的膜锚。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0046786 | viral replication complex formation and maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.451; 覆盖度=100.0; E 值=2.01e-166; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.678; 覆盖度=96.587; E 值=2.08e-165; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.431; 覆盖度=95.904; E 值=5.27e-121; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005774 | vacuolar membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.678; 覆盖度=96.587; E 值=2.08e-165; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009705 | plant-type vacuole membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.451; 覆盖度=100.0; E 值=2.01e-166; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046790 | virion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.639; 覆盖度=98.294; E 值=9.13e-110; UniProt GO evidence=IPI:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G14530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.639; 覆盖度=98.294; E 值=9.13e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.431; 覆盖度=95.904; E 值=5.27e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G21790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.678; 覆盖度=96.587; E 值=2.08e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107769903 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.649; 覆盖度=97.27; E 值=5.93e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |