基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009839 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:134604724-134605131 (-) |
| 描述 | Similar to SAUR22: Auxin-responsive protein SAUR22 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009839 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g18050 |
通过调节生长素运输,作为细胞扩张的正效应因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g18080 |
通过调节生长素运输,作为细胞扩张的正效应因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g18060 |
通过调节生长素运输,作为细胞扩张的正效应因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g18020 |
通过调节生长素运输,作为细胞扩张的正效应因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g18010 |
介导生长素信号与质膜H⁺-ATP酶(AHA1、AHA2)之间的联系;通过抑制PP2C-D类磷酸酶,促进H⁺-ATP酶C端自抑制结构域的磷酸化及酶的活化,从而使质外体酸化,促进溶质和水吸收以及细胞扩张。 |
The SAUR19 subfamily of SMALL AUXIN UP RNA genes promote cell expansion.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04946.x
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=6.1e-34; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=3.05e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009741 | response to brassinosteroid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.778; 覆盖度=66.667; E 值=7.45e-33; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030307 | positive regulation of cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.778; 覆盖度=66.667; E 值=7.45e-33; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000012 | regulation of auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.778; 覆盖度=66.667; E 值=7.45e-33; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=3.05e-35; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=3.05e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=58.889; 覆盖度=66.667; E 值=4.54e-34; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G18010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.778; 覆盖度=66.667; E 值=7.45e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.667; 覆盖度=66.667; E 值=5.35e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=3.05e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.667; 覆盖度=55.556; E 值=6.1e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=58.889; 覆盖度=66.667; E 值=4.54e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |