基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009584 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:129258534-129263824 (+) |
| 描述 | Similar to GIP: Copia protein (Drosophila melanogaster OX%3D7227) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009584 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q94HW2 |
来自转座子 RE1 的逆转录病毒相关 Pol 多蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g02960 |
转座子RE2来源的逆转录病毒相关Pol多蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g50100 |
未表征蛋白 At5g50100,叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006310 | DNA recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.084; 覆盖度=44.033; E 值=1.09e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015074 | DNA integration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071897 | DNA biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.452; 覆盖度=16.214; E 值=2.63e-78; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.452; 覆盖度=16.214; E 值=2.63e-78; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042575 | DNA polymerase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003676 | nucleic acid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003964 | RNA-directed DNA polymerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.086; 覆盖度=43.868; E 值=5.79e-98; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004190 | aspartic-type endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004519 | endonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.086; 覆盖度=43.868; E 值=5.79e-98; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.352; 覆盖度=81.317; E 值=6.48e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015035 | protein-disulfide reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.452; 覆盖度=16.214; E 值=2.63e-78; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G50100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.452; 覆盖度=16.214; E 值=2.63e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |