基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009496 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:127462044-127469679 (-) |
| 描述 | Similar to TAF6: Transcription initiation factor TFIID subunit 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g04950 |
TAF 是转录因子 IID 复合物的组成部分,对于介导 RNA 聚合酶转录的调节至关重要。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051123 | RNA polymerase II preinitiation complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000124 | SAGA complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005669 | transcription factor TFIID complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046695 | SLIK (SAGA-like) complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003713 | transcription coactivator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016251 | RNA polymerase II general transcription initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G04950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.303; 覆盖度=41.121; E 值=7.56e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |