基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009476 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:127124662-127128691 (+) |
| 描述 | Similar to PIMT1: Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009476 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g50240 |
催化肽和蛋白质中 L-异天冬氨酰残基的甲基酯化,这是由正常 L-天冬氨酰和 L-天冬酰胺酰残基自发分解产生的。 | |
At3g48330 |
催化肽和蛋白质中 L-异天冬氨酰残基的甲基酯化,这是由正常 L-天冬氨酰和 L-天冬酰胺酰残基自发分解产生的。 |
A second protein L-isoaspartyl methyltransferase gene in Arabidopsis produces two transcripts whose products are sequestered in the nucleus.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.046094
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006479 | protein methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.294; 覆盖度=65.465; E 值=2.34e-67; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030091 | protein repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032259 | methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.658; 覆盖度=70.27; E 值=2.76e-116; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.294; 覆盖度=65.465; E 值=2.34e-67; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004719 | protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G48330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.0; 覆盖度=66.066; E 值=1.13e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G50240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.658; 覆盖度=70.27; E 值=2.76e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gga:428607 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.294; 覆盖度=65.465; E 值=2.34e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ssc:100502562 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.376; 覆盖度=65.465; E 值=3.81e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |