基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009354 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:123885040-123889708 (+) |
| 描述 | Similar to RMI1: RecQ-mediated genome instability protein 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009354 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g63540 |
RMI 复合物的重要组成部分,该复合物在同源重组的解析步骤中发挥重要作用,以限制细胞中 DNA 交换的形成。 |
The Arabidopsis BLAP75/Rmi1 homologue plays crucial roles in meiotic double-strand break repair.2008 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1000309
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0391000 |
RMI 复合物的重要组成部分,该复合物在同源重组的解析步骤(称为霍利迪连接溶解的过程)中发挥重要作用,以限制细胞中 DNA 交换的形成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000712 | resolution of meiotic recombination intermediates | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006260 | DNA replication | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.798; 覆盖度=24.719; E 值=1.18e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051321 | meiotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016604 | nuclear body | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031422 | RecQ family helicase-topoisomerase III complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000166 | nucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G63540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.943; 覆盖度=39.576; E 值=9.02e-99 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0391000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.386; 覆盖度=25.843; E 值=1.36e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gga:431669 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.798; 覆盖度=24.719; E 值=1.18e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4335680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.386; 覆盖度=25.843; E 值=1.36e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |