基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009255 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:121425956-121428659 (-) |
| 描述 | Similar to Serine/threonine-protein phosphatase PP2A catalytic subunit (Nicotiana tabacum OX%3D4097) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009255 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g58500 |
与PP2A3功能重叠,参与在胚胎发育期间建立生长素梯度、顶端-基底极性轴以及根与芽顶分生组织。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0805300 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶 PP2A-2 催化亚基。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XN40 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶 PP2A-2 催化亚基。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000278 | mitotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006470 | protein dephosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=75.0; 覆盖度=59.669; E 值=1.11e-44; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=75.0; 覆盖度=59.669; E 值=1.11e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000159 | protein phosphatase type 2A complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=75.0; 覆盖度=59.669; E 值=1.11e-44; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=75.0; 覆盖度=59.669; E 值=1.11e-44; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=90.361; 覆盖度=45.856; E 值=9.14e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G58500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=75.0; 覆盖度=59.669; E 值=1.11e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0805300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=90.361; 覆盖度=45.856; E 值=9.14e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107779504 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.852; 覆盖度=59.669; E 值=1.15e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |