基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_008653 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:105299027-105299437 (-) |
| 描述 | Similar to CML45: Probable calcium-binding protein CML45 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_008653 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:1900425 | negative regulation of defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.121; 覆盖度=78.676; E 值=2.14e-17; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.826; 覆盖度=50.735; E 值=1.47e-12; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.0; 覆盖度=48.529; E 值=1.22e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016460 | myosin II complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.826; 覆盖度=50.735; E 值=1.47e-12; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005509 | calcium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.34; 覆盖度=77.941; E 值=1.39e-19; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G29000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.34; 覆盖度=77.941; E 值=1.39e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G47480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.0; 覆盖度=48.529; E 值=1.22e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G39670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.121; 覆盖度=78.676; E 值=2.14e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |