基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_008464 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:100307729-100308420 (-) |
| 描述 | Similar to CCMH: Cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein (Oryza sativa subsp. indica OX%3D39946) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_008464 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g15220 |
在线粒体细胞色素 c 成熟中发挥核心作用。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8AFK5 |
在线粒体细胞色素c成熟中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0275100 |
在线粒体细胞色素c成熟中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.968; 覆盖度=90.751; E 值=1.91e-69; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017004 | cytochrome complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=1.67e-82; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=2.34e-82; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005743 | mitochondrial inner membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=1.67e-82; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.783; 覆盖度=79.769; E 值=7.58e-18; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032991 | protein-containing complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=1.67e-82; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=1.67e-82; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=1.67e-82; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G15220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.968; 覆盖度=90.751; E 值=1.91e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0275100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.026; 覆盖度=89.017; E 值=2.34e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rcp:RCAP_rcc03137 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.333; 覆盖度=62.428; E 值=1.06e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sme:SMc02364 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.783; 覆盖度=79.769; E 值=7.58e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |