基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_008245 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:94722905-94725237 (+) |
| 描述 | Similar to AL5: PHD finger protein ALFIN-LIKE 5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_008245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g20510 |
组蛋白结合组分,特异性识别在“赖氨酸-4”(H3K4)上三甲基化的 H3 尾(H3K4me3),标记几乎所有活跃基因的转录起始位点。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g42790 |
组蛋白结合组分,特异性识别在“赖氨酸-4”(H3K4)上三甲基化的 H3 尾(H3K4me3),标记几乎所有活跃基因的转录起始位点。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0244800 |
组蛋白结合组分,特异性识别在“赖氨酸-4”(H3K4)上三甲基化的 H3 尾(H3K4me3),标记几乎所有活跃基因的转录起始位点。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8BJV8 |
组蛋白结合组分,特异性识别在“赖氨酸-4”(H3K4)上三甲基化的 H3 尾(H3K4me3),标记几乎所有活跃基因的转录起始位点。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006325 | chromatin organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.031; 覆盖度=96.667; E 值=9.39e-123; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045727 | positive regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.561; 覆盖度=97.778; E 值=6.12e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071472 | cellular response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.561; 覆盖度=97.778; E 值=6.12e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003712 | transcription coregulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003714 | transcription corepressor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042393 | histone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G42790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.031; 覆盖度=96.667; E 值=9.39e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G20510 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.698; 覆盖度=98.148; E 值=1.26e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0244800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.549; 覆盖度=98.519; E 值=1.03e-112 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |