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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_008001
当前查询版本OH1004
位置Chr02:79637908-79638608 (-)
描述Similar to LBD39: LOB domain-containing protein 39 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_008001 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37540 含LOB结构域蛋白 39。 暂无已核实直接文献
At3g49940 含LOB结构域的蛋白 38。 暂无已核实直接文献
At5g67420 含LOB结构域的蛋白 37。 暂无已核实直接文献
At3g02550 含LOB结构域蛋白41。 暂无已核实直接文献
At1g67100 含 LOB 结构域的蛋白 40。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.813; 覆盖度=53.5; E 值=2.54e-40; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009739response to gibberellin生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.944; 覆盖度=53.5; E 值=1.32e-39; UniProt GO evidence=IEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010468regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.844; 覆盖度=77.0; E 值=1.31e-48; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0060776simple leaf morphogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.055; 覆盖度=54.5; E 值=1.93e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0071456cellular response to hypoxia生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.813; 覆盖度=53.5; E 值=2.54e-40; UniProt GO evidence=HEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.813; 覆盖度=53.5; E 值=2.54e-40; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.254; 覆盖度=59.0; E 值=1.93e-47; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000976transcription cis-regulatory region binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.055; 覆盖度=54.5; E 值=1.93e-46; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0001217DNA-binding transcription repressor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.844; 覆盖度=77.0; E 值=1.31e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G67100KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.944; 覆盖度=53.5; E 值=1.32e-39UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G02550KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=59.813; 覆盖度=53.5; E 值=2.54e-40UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G49940KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.254; 覆盖度=59.0; E 值=1.93e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G37540KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.844; 覆盖度=77.0; E 值=1.31e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G67420KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.055; 覆盖度=54.5; E 值=1.93e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release