基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007669 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:55694062-55695000 (+) |
| 描述 | Similar to At5g36300: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g36300 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007669 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g42310 |
需要用于叶绿体蛋白合成以及类囊体蛋白复合体亚基的积累。 | |
At5g36300 |
推测的含五肽重复的蛋白 At5g36300。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g39710 |
含五重复肽序列蛋白 At5g39710。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0548300 |
对叶绿体mRNA的加工和翻译是必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.169; 覆盖度=41.784; E 值=3.1e-32; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006417 | regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010239 | chloroplast mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.169; 覆盖度=41.784; E 值=3.1e-32; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.169; 覆盖度=41.784; E 值=3.1e-32; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003727 | single-stranded RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.169; 覆盖度=41.784; E 值=3.1e-32; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G36300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.169; 覆盖度=41.784; E 值=3.1e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42310 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.402; 覆盖度=50.235; E 值=3.84e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0548300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.541; 覆盖度=51.174; E 值=2.62e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |