本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_007555
当前查询版本OH1004
位置Chr02:51937382-51938035 (+)
描述Similar to ATL78: RING-H2 finger protein ATL78 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_007555 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g49230 RING-H2锌指蛋白ATL78。 暂无已核实直接文献
At1g49220 RING-H2指蛋白ATL10。 暂无已核实直接文献
At1g49200 RING-H2指蛋白ATL75。 暂无已核实直接文献
At1g49210 E3 泛素蛋白连接酶,能够与泛素结合酶 E2 UBC8 在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献
At3g18773 RING-H2 指蛋白 ATL77。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009409response to cold生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009414response to water deprivation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G49200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.948; 覆盖度=98.157; E 值=2.3e-61UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G49210KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.829; 覆盖度=94.47; E 值=1.73e-59UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G49220KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.058; 覆盖度=94.931; E 值=2.16e-61UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G49230KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.768; 覆盖度=97.235; E 值=5.22e-80UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G18773KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.284; 覆盖度=100.461; E 值=5.43e-53UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release