基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007269 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:42070750-42072243 (-) |
| 描述 | Similar to BHLH121: Transcription factor bHLH121 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007269 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g19860 |
转录因子 bHLH121。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g36060 |
转录因子bHLH11。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g54680 |
转录因子。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0379300 |
转录因子,作为缺铁反应的负调节因子。 | |
Os07g0628500 |
在盐胁迫耐受中起正调控作用的转录因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.888; 覆盖度=44.353; E 值=3.41e-20; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006879 | intracellular iron ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010039 | response to iron ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.069; 覆盖度=55.647; E 值=3.4e-41; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019760 | glucosinolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.888; 覆盖度=44.353; E 值=3.41e-20; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.069; 覆盖度=55.647; E 值=3.4e-41; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.706; 覆盖度=37.466; E 值=3.17e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990837 | sequence-specific double-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G19860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.913; 覆盖度=76.033; E 值=1.39e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G36060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.069; 覆盖度=55.647; E 值=3.4e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G54680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.888; 覆盖度=44.353; E 值=3.41e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0379300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=39.706; 覆盖度=37.466; E 值=3.17e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0628500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.211; 覆盖度=39.118; E 值=1.44e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |