基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007108 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:36579109-36582635 (+) |
| 描述 | Similar to ACA8: Calcium-transporting ATPase 8%2C plasma membrane-type (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007108 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g57110 |
这种依赖镁的酶催化ATP的水解,同时将钙从胞质转运出细胞。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g29900 |
这种镁依赖性酶催化ATP的水解,同时将钙从胞质转运到内质网。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g21180 |
这种依赖镁的酶催化ATP水解,并伴随钙离子从胞质转运出细胞或进入细胞器。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0605500 |
这种依赖镁的酶催化 ATP 水解,并伴随钙从细胞质外运入内质网或细胞器(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0136900 |
这种依赖镁的酶催化ATP水解,同时将钙从胞质转运出细胞、进入内质网或进入细胞器。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.086; 覆盖度=34.105; E 值=5.48e-36; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.086; 覆盖度=34.105; E 值=5.48e-36; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009624 | response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051480 | regulation of cytosolic calcium ion concentration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.307; 覆盖度=34.316; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005388 | P-type calcium transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005516 | calmodulin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016887 | ATP hydrolysis activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G29900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.307; 覆盖度=34.316; E 值=1.44e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G57110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.012; 覆盖度=34.947; E 值=4.71e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0605500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.086; 覆盖度=34.105; E 值=5.48e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |