基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005739 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:172548920-172553812 (-) |
| 描述 | Similar to NLP6: Protein NLP6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005739 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g64530 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g24020 |
参与硝酸盐同化调节和硝酸盐信号转导的转录因子。 | |
At1g76350 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g59580 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0236700 |
可能的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010118 | stomatal movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010167 | response to nitrate | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042128 | nitrate assimilation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000987 | cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001046 | core promoter sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001216 | DNA-binding transcription activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.144; 覆盖度=73.46; E 值=2.73e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G64530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=25.211; 覆盖度=104.106; E 值=1.92e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G24020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.876; 覆盖度=70.674; E 值=1.03e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0236700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.144; 覆盖度=73.46; E 值=2.73e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |