基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005400 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:162648603-162649249 (+) |
| 描述 | Similar to RTM1: Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005400 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: D9UBG0 |
在不引起过敏反应或不诱导系统性获得性抗性的情况下,无法介导病原烟草刻蚀病毒(TEV)的长距离运动限制。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: D9UBI3 |
在不引起过敏反应或不诱导系统性获得性抗性的情况下,无法介导病原烟草刻蚀病毒(TEV)的长距离运动限制。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g05760 |
需要限制烟草花叶病毒(TEV)的长距离传播,而不引起高敏反应或诱导系统获得性抗性。 |
Cloning of the Arabidopsis RTM1 gene, which controls restriction of long-distance movement of tobacco etch virus.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.1.489
|
At1g05770 |
甘露素凝集素相关蛋白2。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g43730 |
Jacalin相关凝集素24。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=2.03e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009615 | response to virus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=7.09e-23; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046741 | transport of virus in host, tissue to tissue | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=7.09e-23; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051607 | defense response to virus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=7.09e-23; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=2.03e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030246 | carbohydrate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=2.03e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G05760 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.313; 覆盖度=96.237; E 值=7.09e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G05770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.052; 覆盖度=103.763; E 值=1.8e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G43730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.056; 覆盖度=86.559; E 值=5.86e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |