基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003526 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:82360371-82366223 (+) |
| 描述 | Similar to NEK5: Serine/threonine-protein kinase Nek5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003526 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g44200 |
参与下胚轴和根部的表皮细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0864700 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0440800 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0604700 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2ZMH2 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007017 | microtubule-based process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043622 | cortical microtubule organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090627 | plant epidermal cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055028 | cortical microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G44200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.353; 覆盖度=70.284; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0864700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.204; 覆盖度=55.814; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0440800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=62.162; 覆盖度=57.364; E 值=6.23e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4324792 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.204; 覆盖度=55.814; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4338922 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=62.162; 覆盖度=57.364; E 值=6.23e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |