基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002552 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:51422239-51424266 (-) |
| 描述 | Similar to ROPGEF12: Rop guanine nucleotide exchange factor 12 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_002552 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g79860 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 ，通过促进 GDP 与 GTP 的交换，充当 RopGTP 酶的激活剂。 | |
At3g24620 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 ，通过促进 GDP 与 GTP 的交换，充当 RopGTP 酶的激活剂。 | |
At1g52240 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 ，通过促进 GDP 与 GTP 的交换，充当 RopGTP 酶的激活剂。 | |
At4g13240 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 (GEF)，通过促进 GDP 与 GTP 的交换，充当 Rop（植物的 Rho）GTP 酶的激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19560 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 (GEF)，通过促进 GDP 与 GTP 的交换，充当 Rop（植物的 Rho）GTP 酶的激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.56; 覆盖度=88.521; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080092 | regulation of pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080147 | root hair cell development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.56; 覆盖度=88.521; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=55.819; 覆盖度=90.272; E 值=1.77e-169; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=57.469; 覆盖度=93.774; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016324 | apical plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=55.819; 覆盖度=90.272; E 值=1.77e-169; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090406 | pollen tube | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005085 | guanyl-nucleotide exchange factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.638; 覆盖度=90.272; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G52240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.56; 覆盖度=88.521; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G79860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.168; 覆盖度=87.938; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G24620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.638; 覆盖度=90.272; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G13240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=57.469; 覆盖度=93.774; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=55.819; 覆盖度=90.272; E 值=1.77e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |