基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002536 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:51002997-51004031 (+) |
| 描述 | Similar to HSFC1: Heat stress transcription factor C-1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002536 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g24520 |
转录调控因子,特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3',该序列称为热休克启动子元件(HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0232000 |
转录调控因子,特异性结合热休克启动子元素(HSE)的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0733200 |
转录调控因子,特异性结合热休克启动子元素(HSE)的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0625300 |
转录调控因子,特异性结合热休克启动子元素(HSE)的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0553100 |
转录调控因子,特异性结合热休克启动子元素(HSE)的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006970 | response to osmotic stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.409; 覆盖度=56.958; E 值=7.75e-59; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.409; 覆盖度=56.958; E 值=7.75e-59; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034605 | cellular response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000978 | RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G24520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.894; 覆盖度=60.841; E 值=7.21e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0625300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.534; 覆盖度=72.168; E 值=7.15e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0733200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.409; 覆盖度=56.958; E 值=7.75e-59 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0232000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.444; 覆盖度=58.252; E 值=6.02e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0553100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=54.749; 覆盖度=57.929; E 值=1.25e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |