RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_002386
当前查询版本OH1004
位置Chr01:47672023-47673692 (-)
描述Similar to ALP1: Protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002386 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63270 来源于转座酶的蛋白，可能具有核酸酶活性（可能）。
Kicking against the PRCs - A Domesticated Transposase Antagonises Silencing Mediated by Polycomb Group Proteins and Is an Accessory Component of Polycomb Repressive Complex 2.2015 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005660
At3g55350 来源于转座酶的蛋白，可能具有核酸酶活性。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0040029epigenetic regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000118histone deacetylase complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.79; 覆盖度=61.248; E 值=3.5e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.381; 覆盖度=36.673; E 值=1.75e-20; UniProt GO evidence=IDA:HPAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.381; 覆盖度=36.673; E 值=1.75e-20; UniProt GO evidence=IDA:HPAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0035098ESC/E(Z) complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0035102PRC1 complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003682chromatin binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004518nuclease activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016787hydrolase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0046872metal ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G55350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.79; 覆盖度=61.248; E 值=3.5e-42UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G63270KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.438; 覆盖度=60.491; E 值=2.47e-43UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGbta:514442KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.897; 覆盖度=36.673; E 值=4.59e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGhsa:283254KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.381; 覆盖度=36.673; E 值=1.75e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGrno:690164KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=29.381; 覆盖度=36.673; E 值=5.74e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release