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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_002020
当前查询版本OH1004
位置Chr01:39716155-39718169 (-)
描述Similar to At1g80170: Probable polygalacturonase At1g80170 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_002020 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g80170 可能是多聚半乳糖醛酸酶At1g80170。 暂无已核实直接文献
At3g57510 多聚半乳糖醛酸酶参与荚果破碎最后阶段的细胞分离和花药开裂。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0005975carbohydrate metabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.354; 覆盖度=89.201; E 值=3.28e-179; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009830cell wall modification involved in abscission生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.708; 覆盖度=76.242; E 值=3.46e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009835fruit ripening生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.708; 覆盖度=76.242; E 值=3.46e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009901anther dehiscence生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.708; 覆盖度=76.242; E 值=3.46e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010047fruit dehiscence生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.708; 覆盖度=76.242; E 值=3.46e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045490pectin catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.817; 覆盖度=80.346; E 值=8.29e-107; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0071555cell wall organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.354; 覆盖度=89.201; E 值=3.28e-179; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.354; 覆盖度=89.201; E 值=3.28e-179; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.817; 覆盖度=80.346; E 值=8.29e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004650polygalacturonase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.354; 覆盖度=89.201; E 值=3.28e-179; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G80170KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.354; 覆盖度=89.201; E 值=3.28e-179UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G57510KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.817; 覆盖度=80.346; E 值=8.29e-107UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release