基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000940 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:16995590-16998198 (+) |
| 描述 | Similar to XBOS34: Probable E3 ubiquitin-protein ligase XBOS34 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000940 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g35910 |
在 tRNA 的摇摆位点（tRNA(Lys)、tRNA(Glu) 和 tRNA(Gln)）的 mcm(5)S(2)U 的 2-硫化中起核心作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0446100 |
可能的E3泛素蛋白连接酶XBOS34。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002143 | tRNA wobble position uridine thiolation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.222; 覆盖度=64.286; E 值=3.63e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032447 | protein urmylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034227 | tRNA thio-modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000049 | tRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.222; 覆盖度=64.286; E 值=3.63e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016779 | nucleotidyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016783 | sulfurtransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.222; 覆盖度=64.286; E 值=3.63e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G35910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.967; 覆盖度=32.5; E 值=4.19e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0446100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.222; 覆盖度=64.286; E 值=3.63e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |