基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000197 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:3893560-3898503 (-) |
| 描述 | Similar to GYRB: DNA gyrase subunit B%2C chloroplastic/mitochondrial (Nicotiana benthamiana OX%3D4100) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000197 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 7 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g04130 |
一种II型拓扑异构酶，能够以ATP依赖的方式对闭合环状双链DNA进行负超螺旋。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g10270 |
一种II型拓扑异构酶，能够以ATP依赖的方式对闭合环状双链DNA进行负超螺旋。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0268300 |
一种II型拓扑异构酶，能够以ATP依赖的方式对闭合环状双链DNA进行负超螺旋。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006261 | DNA-templated DNA replication | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.454; 覆盖度=88.467; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006265 | DNA topological change | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005694 | chromosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.783; 覆盖度=100.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.783; 覆盖度=100.136; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034335 | DNA negative supercoiling activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.764; 覆盖度=100.543; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G10270 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=69.783; 覆盖度=100.136; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G04130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.061; 覆盖度=89.552; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0268300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=72.985; 覆盖度=90.909; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tma:TM0833 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.454; 覆盖度=88.467; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tmi:THEMA_00475 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.454; 覆盖度=88.467; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tmm:Tmari_0835 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.454; 覆盖度=88.467; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tmw:THMA_0854 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.454; 覆盖度=88.467; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |