基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000115 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:2581858-2583355 (-) |
| 描述 | Similar to FOLD1: Bifunctional protein FolD 1%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000115 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g38660 |
催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g00620 |
催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g12290 |
催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g00600 |
催化5,10-亚甲基四氢叶酸氧化为5,10-亚甲酰四氢叶酸,然后水解5,10-亚甲酰四氢叶酸生成10-甲酰四氢叶酸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000105 | L-histidine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.827; 覆盖度=78.533; E 值=5.54e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006164 | purine nucleotide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.827; 覆盖度=78.533; E 值=5.54e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009086 | methionine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.827; 覆盖度=78.533; E 值=5.54e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009853 | photorespiration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035999 | tetrahydrofolate interconversion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046653 | tetrahydrofolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.305; 覆盖度=80.163; E 值=5.94e-121; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=63.14; 覆盖度=79.62; E 值=7.23e-135; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004477 | methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004488 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G38660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.058; 覆盖度=93.75; E 值=1.75e-156 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G12290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.305; 覆盖度=80.163; E 值=5.94e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G00600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.584; 覆盖度=79.62; E 值=1.13e-105 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G00620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=63.14; 覆盖度=79.62; E 值=7.23e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mta:Moth_1516 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.827; 覆盖度=78.533; E 值=5.54e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |