基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G230560 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:60072474-60078166 (+) |
| 描述 | Similar to RBP47B': Polyadenylate-binding protein RBP47B' (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_033101 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g19350 |
异质核核糖核蛋白（hnRNP）蛋白，结合mRNA的poly(A)尾，可能参与前mRNA成熟的某些步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g27000 |
异质核核糖核蛋白（hnRNP）蛋白，结合mRNA的poly(A)尾，可能参与前mRNA成熟的某些步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g63530 |
E3 泛素蛋白连接酶，以剂量依赖性方式限制器官大小，可能还限制种子大小。 | |
At5g54900 |
异质核核糖核蛋白（hnRNP）蛋白，结合mRNA的poly(A)尾，可能参与前mRNA成熟的某些步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0625800 |
RNA 结合蛋白，与谷醇溶蛋白 RNA 的 5'-CDS 内的顺式定位元件或邮政编码结合。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000398 | mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.755; 覆盖度=40.585; E 值=6.08e-121; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010193 | response to ozone | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.825; 覆盖度=41.404; E 值=2.35e-115; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034605 | cellular response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048573 | photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.825; 覆盖度=41.404; E 值=2.35e-115; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005685 | U1 snRNP | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010494 | cytoplasmic stress granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.825; 覆盖度=41.404; E 值=2.35e-115; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008143 | poly(A) binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G11650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=52.825; 覆盖度=41.404; E 值=2.35e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19350 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.965; 覆盖度=50.409; E 值=4.44e-174 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |