本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA08G188610
当前查询版本TK1151
位置Chr08:49293174-49295733 (-)
描述Similar to U2AF35A: Splicing factor U2af small subunit A (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_032566 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g42820 对前mRNA的剪接是必需的(按相似性)。 暂无已核实直接文献
At1g27650 对前mRNA的剪接是必需的(按相似性)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0491756 前体 mRNA 剪接所必需的。 暂无已核实直接文献
Os05g0564200 前体 mRNA 剪接所必需的。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0000398mRNA splicing, via spliceosome生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048573photoperiodism, flowering生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.966; 覆盖度=87.087; E 值=2.38e-127; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005681spliceosomal complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.716; 覆盖度=60.36; E 值=1.74e-79; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016607nuclear speck细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.966; 覆盖度=87.087; E 值=2.38e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0089701U2AF complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0030628pre-mRNA 3'-splice site binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G27650KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.789; 覆盖度=91.291; E 值=8.49e-122UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G42820KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.966; 覆盖度=87.087; E 值=2.38e-127UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os05g0564200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=78.919; 覆盖度=55.556; E 值=3.24e-115UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os09g0491756KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.102; 覆盖度=88.589; E 值=2.09e-127UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGrno:361542KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.716; 覆盖度=60.36; E 值=1.74e-79UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release