基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G047640 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:12903160-12912176 (-) |
| 描述 | Similar to HULK1: Protein HUA2-LIKE 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025641 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23150 |
通过提高FLC、FLM/MAF1、MAF2和SVP等延迟开花基因的表达,抑制开花的转录因子。 |
HUA1 and HUA2 are two members of the floral homeotic AGAMOUS pathway.1999 · DOI: 10.1016/s1097-2765(00)80462-1 Two RNA binding proteins, HEN4 and HUA1, act in the processing of AGAMOUS pre-mRNA in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1016/s1534-5807(02)00399-4
|
At5g08230 |
可能的转录因子,与 HULK2 和 HULK3 具有部分冗余作用。 | |
At2g48160 |
可能的转录因子,与 HULK1 和 HULK3 具有部分冗余作用。 | |
At3g63070 |
可能的转录因子,与 HULK1 和 HULK2 具有部分冗余作用。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006338 | chromatin remodeling | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G48160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.235; 覆盖度=20.4; E 值=7.23e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G63070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.149; 覆盖度=27.44; E 值=2.17e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G08230 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.31; 覆盖度=40.24; E 值=7.66e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |