基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G067370 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:17985044-17994618 (+) |
| 描述 | Similar to HCF244: Protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019596 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g35250 |
与HCF173共同参与光系统Ⅱ(PSII)的生物发生,尤其通过促进psbA mRNA翻译起始时的核糖体装载及其稳定性,支持反应中心D1蛋白的合成。 |
ONE-HELIX PROTEIN2 (OHP2) Is Required for the Stability of OHP1 and Assembly Factor HCF244 and Is Functionally Linked to PSII Biogenesis.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00540
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010207 | photosystem II assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015979 | photosynthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.359; 覆盖度=66.809; E 值=5.2e-114; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009523 | photosystem II | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003743 | translation initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.359; 覆盖度=66.809; E 值=5.2e-114; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G35250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.919; 覆盖度=73.662; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr0399 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.059; 覆盖度=69.165; E 值=1.35e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |