基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G007760 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:2264779-2269380 (-) |
| 描述 | Similar to NYC1: Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002546 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0227100 |
对正确的叶绿体降解所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0654600 |
叶绿素b降解所需。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010304 | PSII associated light-harvesting complex II catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IMP:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015996 | chlorophyll catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IMP:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.031; 覆盖度=21.934; E 值=1.38e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.796; 覆盖度=37.306; E 值=3.38e-128; UniProt GO evidence=IC:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IDA:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IDA:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034256 | chlorophyll(ide) b reductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G13250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.796; 覆盖度=37.306; E 值=3.38e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G04900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.031; 覆盖度=21.934; E 值=1.38e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0227100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |