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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA05G007760
当前查询版本TK1151
位置Chr05:2264779-2269380 (-)
描述Similar to NYC1: Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_002546 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g13250 参与叶绿素 b 降解。
At5g04900 叶绿素b降解所需。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0227100 对正确的叶绿体降解所必需。 暂无已核实直接文献
Os03g0654600 叶绿素b降解所需。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0010304PSII associated light-harvesting complex II catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IMP:GrameneUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015996chlorophyll catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IMP:GrameneUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.031; 覆盖度=21.934; E 值=1.38e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.796; 覆盖度=37.306; E 值=3.38e-128; UniProt GO evidence=IC:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009535chloroplast thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009536plastid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IDA:GrameneUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016491oxidoreductase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IDA:GrameneUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0034256chlorophyll(ide) b reductase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G13250KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.796; 覆盖度=37.306; E 值=3.38e-128UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G04900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.031; 覆盖度=21.934; E 值=1.38e-26UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os01g0227100KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.432; 覆盖度=46.805; E 值=3.23e-132UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release