基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G474560 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:119843512-119844950 (-) |
| 描述 | Similar to PP2B13: F-box protein PP2-B13 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038886 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.355; 覆盖度=100.356; E 值=1.63e-85; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.909; 覆盖度=97.865; E 值=4.88e-57; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.355; 覆盖度=100.356; E 值=1.63e-85; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030246 | carbohydrate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.355; 覆盖度=100.356; E 值=1.63e-85; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09155 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.043; 覆盖度=100.0; E 值=6.38e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G56240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.355; 覆盖度=100.356; E 值=1.63e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G56250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.357; 覆盖度=99.644; E 值=4.64e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.434; 覆盖度=100.0; E 值=4.86e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |