基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G123760 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:32146308-32149082 (-) |
| 描述 | Similar to PSI1: Protein PSK SIMULATOR 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035558 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g08660 |
促进植物生长,尤其在营养生长期,可能通过调控植物硫激肽(PSK)信号;PSK是作为生长因子的肽类植物激素。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006109 | regulation of carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009744 | response to sucrose | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.167; 覆盖度=34.855; E 值=9.81e-11; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043434 | response to peptide hormone | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045927 | positive regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.167; 覆盖度=34.855; E 值=9.81e-11; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.167; 覆盖度=34.855; E 值=9.81e-11; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003746 | translation elongation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.711; 覆盖度=34.44; E 值=4.22e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30755 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.711; 覆盖度=34.44; E 值=4.22e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G34320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=30.498; E 值=1.78e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G08660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.167; 覆盖度=34.855; E 值=9.81e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |