RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA03G555010
当前查询版本TK1151
位置Chr03:140513202-140516154 (+)
描述Similar to NRPE5C: DNA-directed RNA polymerase V subunit 5C (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010907 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54490 DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 暂无已核实直接文献
At2g41340 DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 暂无已核实直接文献
At3g57080 DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。
Identification of genes required for de novo DNA methylation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.4161/epi.6.3.14242

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006362transcription elongation by RNA polymerase I生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006366transcription by RNA polymerase II生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042797tRNA transcription by RNA polymerase III生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000418RNA polymerase IV complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.593; 覆盖度=93.506; E 值=8.47e-56; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000419RNA polymerase V complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005665RNA polymerase II, core complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005666RNA polymerase III complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005736RNA polymerase I complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003899DNA-directed RNA polymerase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G41340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.593; 覆盖度=93.506; E 值=8.47e-56UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G22320KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G54490KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G57080KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.283; 覆盖度=91.775; E 值=6.06e-57UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGcbr:CBG_12745KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.171; 覆盖度=88.745; E 值=1.98e-31UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release