基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G364150 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:89833676-89834319 (+) |
| 描述 | Similar to Os03g0733400: Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000470 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g42170 |
类转座酶蛋白,对植物生长发育至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0733400 |
类转座酶蛋白,对植物生长发育至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0518400 |
类转座酶蛋白,对植物生长发育至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006310 | DNA recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.898; 覆盖度=34.186; E 值=8.86e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009791 | post-embryonic development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032196 | transposition | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.898; 覆盖度=34.186; E 值=8.86e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.759; 覆盖度=34.186; E 值=8.39e-29; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G42170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.759; 覆盖度=34.186; E 值=8.39e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0733400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.947; 覆盖度=34.735; E 值=6.34e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0239150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.436; 覆盖度=35.649; E 值=2.62e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |