基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G163320 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:41420532-41423616 (-) |
| 描述 | Similar to YNL011C: Uncharacterized protein YNL011C (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX%3D559292) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027331 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g28290 |
染色质结构重塑复合体(RSC)的催化组分,参与转录调控和核小体定位。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g06010 |
可能的染色质重塑因子,在根和茎干细胞起始、根尖分生组织 和茎尖分生组织 维持中与 CHR23 功能冗余。 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling gene AtCHR12 mediates temporary growth arrest in Arabidopsis thaliana upon perceiving environmental stress.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03185.x
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0008360 | regulation of cell shape | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.415; 覆盖度=65.298; E 值=2.54e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.415; 覆盖度=65.298; E 值=2.54e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043743 | LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.094; 覆盖度=85.626; E 值=7.46e-65; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | bha:BH3568 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.415; 覆盖度=65.298; E 值=2.54e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU34760 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=25.915; 覆盖度=72.895; E 值=5.31e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cac:CA_C0512 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.582; 覆盖度=64.887; E 值=1.9e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | lmo:lmo2473 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.141; 覆盖度=72.69; E 值=6.93e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sce:YNL011C | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.094; 覆盖度=85.626; E 值=7.46e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |