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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA03G159420
当前查询版本TK1151
位置Chr03:40420183-40421793 (-)
描述Similar to PCMP-H6: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g33760 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_007337 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46790 叶绿体 rsp7 和 ndhB 转录物之间的基因间加工所需。 暂无已核实直接文献
At1g50270 含五聚肽重复序列的蛋白At1g50270。 暂无已核实直接文献
At3g11460 参与线粒体 RNA 的 C 到 U 编辑。
At5g39350 含五肽重复的蛋白 At5g39350。 暂无已核实直接文献
At4g38010 含五重复肽结构蛋白 At4g38010。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031425chloroplast RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080156mitochondrial mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.464; 覆盖度=95.336; E 值=4.87e-96; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.464; 覆盖度=95.336; E 值=4.87e-96; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G50270KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.364; 覆盖度=86.194; E 值=9.47e-96UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G33760KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.332; 覆盖度=87.127; E 值=5.83e-99UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G12770KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=33.464; 覆盖度=95.336; E 值=4.87e-96UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release