基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G540360 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:139400909-139404828 (-) |
| 描述 | Similar to At3g02760: Histidine--tRNA ligase%2C cytoplasmic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012744 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g02760 |
组氨酰-tRNA合成酶,胞质。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0150900 |
组氨酰-tRNA合成酶,胞质。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006427 | histidyl-tRNA aminoacylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032543 | mitochondrial translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.097; 覆盖度=51.89; E 值=1.07e-146; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004821 | histidine-tRNA ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.747; 覆盖度=52.463; E 值=1.49e-146; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.097; 覆盖度=51.89; E 值=1.07e-146; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G02760 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.609; 覆盖度=103.207; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bta:510937 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.097; 覆盖度=51.89; E 值=1.07e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddi:DDB_G0274159 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=51.802; 覆盖度=50.859; E 值=4.95e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0150900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.897; 覆盖度=89.347; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:15115 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.747; 覆盖度=52.463; E 值=1.49e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |