基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G628400 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:158901021-158902034 (+) |
| 描述 | Similar to Os11g0706600: Thaumatin-like protein (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000192 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g18250 |
类雷霆蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g24180 |
参与根对非致病性促进植物生长根际细菌(PGPR)荧光假单胞菌属(Pseudomonas spp.)的定殖的局部反应,但似乎不需要用于随后诱导系统抗性(ISR)的建立。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0706600 |
类雷霆蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.471; 覆盖度=91.02; E 值=1.43e-102; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.578; 覆盖度=101.633; E 值=2.53e-65; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009682 | induced systemic resistance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.578; 覆盖度=101.633; E 值=2.53e-65; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009723 | response to ethylene | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.578; 覆盖度=101.633; E 值=2.53e-65; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.872; 覆盖度=88.98; E 值=3.03e-71; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.364; 覆盖度=89.796; E 值=6.99e-77; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.364; 覆盖度=89.796; E 值=6.99e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G24180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.578; 覆盖度=101.633; E 值=2.53e-65 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0706600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.471; 覆盖度=91.02; E 值=1.43e-102 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |