基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G566490 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:142572272-142575641 (+) |
| 描述 | Similar to TIFY4B: Protein TIFY 4B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001019 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g14720 |
调控叶片发育过程中分散分生组织细胞的生长停滞。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14713 |
调控叶片发育过程中分散分生组织细胞的生长停滞。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0615200 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YNP2 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0402800 |
茉莉酸响应抑制因子(通过相似性预测)。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2Z6V6 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.168; 覆盖度=38.305; E 值=3.45e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.095; 覆盖度=71.186; E 值=8.14e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.095; 覆盖度=71.186; E 值=8.14e-08; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042127 | regulation of cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.514; 覆盖度=100.339; E 值=1.14e-49; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901371 | regulation of leaf morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000022 | regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.095; 覆盖度=71.186; E 值=8.14e-08; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G17380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.095; 覆盖度=71.186; E 值=8.14e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14713 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.514; 覆盖度=100.339; E 值=1.14e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.993; 覆盖度=95.254; E 值=1.73e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0615200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.168; 覆盖度=38.305; E 值=3.45e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |