基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G041420 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:10651263-10651763 (-) |
| 描述 | Similar to SAUR36: Auxin-responsive protein SAUR36 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005500 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g45210 |
作为叶片衰老的正调节因子,可能介导生长素诱导的叶片衰老。 | |
At2g46690 |
可能在顶端钩发育中发挥作用(参考文献7)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.156; 覆盖度=45.833; E 值=7.51e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010029 | regulation of seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900057 | positive regulation of leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900140 | regulation of seedling development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.238; 覆盖度=50.0; E 值=1.51e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.238; 覆盖度=50.0; E 值=1.51e-18; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.238; 覆盖度=50.0; E 值=1.51e-18; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.455; 覆盖度=45.833; E 值=8.03e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G45210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=100.0; E 值=3e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G46690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.238; 覆盖度=50.0; E 值=1.51e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.156; 覆盖度=45.833; E 值=7.51e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.455; 覆盖度=45.833; E 值=8.03e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:100777479 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.059; 覆盖度=40.476; E 值=1.85e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |